ゴジラ生誕20周年記念作品。ブラックホール第3惑星人がゴジラそっくりのロボット、メカゴジラを使い地球侵略を企てる。ゴジラはアンギラスとともに迎え撃つが返り撃ちに遭う。しかし沖縄の伝説怪獣キングシーサーがよみがえり、ゴジラとともに逆襲に転じる。メカゴジラのキャラクターが大好評を博す。

和平的比斯拉多星（ピースランド星），受到格羅加巴蘭星人（ガロガバラン星人）的侵略而滅亡。其中有一家比斯拉多星人，乘坐宇宙船巴多拉膠囊（パンドラカプセル）流亡到地球。身為難民的他們，化姓氏為防人（さきもり），開始在地球上的新生活。不過格羅加巴蘭星人把地球作為第二侵略目標，並建立了宇宙要塞把怪獸送到地球。把地球作為第二故鄉…